بدأ قسم الجغرافیا فی جامعة یزد نشاطه عام 1977 من خلال برنامج تعلیم الجغرافیا فی کلیة التربیة التابعة لجامعة إعداد المعلمین فی یزد. وبعد توقف مؤقت خلال الثورة الثقافیة، استأنف القسم نشاطه فی عام 1983. وفی عام 1984، تم قبول أول دفعة من الطلاب بعد الثورة فی برنامج الجغرافیا بکلیة التربیة فی یزد.

خلال سبعینیات القرن العشرین، کان القسم یقبل الطلاب فی مجالین هما: الجغرافیا البشریة والجغرافیا الطبیعیة. وفی أواخر السبعینیات، أُضیفت تخصصات تخطیط المدن والجغرافیا إلى برامج البکالوریوس والدراسات العلیا. کما أُدرج برنامج الماجستیر فی علم المناخ خلال الثمانینیات.

وفی بدایة القرن الواحد والعشرین، یفخر قسم الجغرافیا بجامعة یزد بتقدیم برامج دکتوراه فی علم المناخ، والجغرافیا، وتخطیط المدن. ومنذ أوائل التسعینیات، بدأ القسم فی قبول طلاب الدکتوراه فی علم المناخ مع تخصص فی مخاطر الطقس، بالإضافة إلى الدکتوراه فی الجغرافیا وتخطیط المدن.

یتکون القسم حالیًا من قسمین رئیسیین: إدارة الأراضی والتخطیط البیئی، ویضمّ إجمالی 15 عضوًا فی هیئة التدریس، منهم 3 أساتذة، و6 أساتذة مشارکین، و6 أساتذة مساعدین.

على مر السنین، شهدت طرق التدریس، وورش العمل، والوسائل التعلیمیة فی مجال الجغرافیا تطورًا ملحوظًا، حیث برزت الجغرافیا کتخصص عملی عالی التنوع والابتکار، یتمتع بتوجهات متعددة ومختلفة.