بدأ قسم الفیزیاء فی جامعة یزد نشاطه التعلیمی بالتزامن مع تأسیس الجامعة، وذلک من خلال برنامجی الفیزیاء النوویة وفیزیاء الحالة الصلبة. ومع مرور الوقت، أُضیفت تخصصات الفیزیاء الذریة والجزیئیة، وفیزیاء الجسیمات، والأرصاد الجویة. ویضم القسم حالیًا خمسة مجالات علمیة رئیسة هی: فیزیاء البصریات واللیزر، وفیزیاء الجسیمات ونظریة الحقول، وفیزیاء البلازما، والفیزیاء النوویة، وفیزیاء المادة المکثفة، ویقدّم برامج أکادیمیة فی مراحل البکالوریوس والماجستیر والدکتوراه.
یضم القسم حالیاً 26 عضوًا من أعضاء هیئة التدریس العاملین، إضافةً إلى أربعة أعضاء متقاعدین وعضوین منتسبین. ویبلغ عدد طلاب القسم نحو 300 طالب فی مرحلة البکالوریوس، و200 طالب فی مرحلتی الماجستیر والدکتوراه فی مختلف تخصصات الفیزیاء.
وترکز الأنشطة البحثیة فی القسم على عدد من المجالات، أبرزها: الفیزیاء النظریة والتجریبیة للمادة المکثفة، وفیزیاء النانو، وفیزیاء الطاقة العالیة والجسیمات، والفیزیاء النوویة، والفیزیاء الذریة النظریة، والخلایا الشمسیة، وفیزیاء اللیزر والبصریات، وفیزیاء البلازما، والأرصاد الجویة.