این شورا مرجع اصلی تصمیم گیری در رابطه با فعالیت ها و متولی اجرای برنامه های کانون می‌باشد. در حال مسئولیتهای تعریف شده در شورای کانون به شرح زیر هستند:
- مسئول کانون
- معاونت تبیین و گفتمان‌سازی
- معاونت فرهنگی اجتماعی
- معاونت زنان و خانواده
- معاونت علمی - پژوهشی
- دبیر شورای اندیشه‌ورزی
- معاونت تربیت و آموزش
- معاونت فناوری و کارآفرینی
- مدیر گروه جهادی
- معاونت فضای مجازی و رسانه
- معاونت بررسی و تحلیل