یکی از باسابقه‌ترین رشته‌های دانشگاه یزد، فقه و حقوق اسلامی می‌باشد، که از کنکور سال ۱۳۷۶ اقدام به پذیرش دانشجو در مقطع کارشناسی کرد. دانشجویان این رشته ابتدا از سال ۱۳۸۰ در قالب گروه‌های دانشجویی اقدام به فعالیت‌های علمی و پژوهشی کردند تا سرانجام در سال ۱۳۸۴ موفق به تاسیس انجمن علمی فقه و حقوق اسلامی شدند که اکنون یکی از موفق‌ترین انجمن‌های علمی دانشگاه یزد محسوب می‌گردد. نهاد انجمن علمی فقه و حقوق اسلامی دانشگاه یزد، رسالت خود را با محوریت مبناشناسی فقهی مباحث و مسائل حقوقی، همگام با قانون و فقه غنی و پویای ایران اسلامی و شیعی، دنبال می‌کند.