در راستای اهداف ملی توسعه کشور و اهداف و ماموریت‌های سازمان‌ها و مراکز علمی و پژوهشی کشور و با در نظر گرفتن قابلیت‌ها و توانمندی‌های پژوهشی و فناوری دانشگاه یزد و دیگر مراکز آموزشی، پژوهشی و فناوری همکار، اهداف این پژوهشکده به شرح زیر است.

اهداف:

• فراهم‌سازی امکانات، تجهیزات و نیروی علمی لازم جهت همکاری با مراکز علمی- پژوهشی داخل و خارج کشور و واحدهای اجرایی و به منظور اجرای طرح‌های تحقیقاتی
• تعیین اولویت طرح‌های اجرایی، در راستای توسعه پایدار منابع طبیعی و کشاورزی در مناطق خشک
• انجام پژوهش‌های مختلف در راستای بهره‌برداری بهینه از منابع محدود آب و خاک در مناطق خشک و نیمه‌خشک
• اهتمام در افزایش بهره‌وری در عرصه‌های کشاورزی و منابع طبیعی
• هدایت و اجرای پژوهش‌های مختلف برای اعمال روش‌های مدیریت مبتنی بر دانش در مناطق خشک و بیابانی
• شناسایی گیاهان کم‌آبخواه و تغییر الگوی کشت در عرصه‌های منابع طبیعی، کشاورزی، و فضای سبز شهری
• شناسایی عوامل موثر در بیابان‌زایی و ارائه راهکارهای علمی جهت مقابله با آن
• برگزاری کارگاه‌های آموزشی- پژوهشی و کنفرانس‌های علمی ونمایشگاه‌های تخصصی
• راه‌اندازی و همکاری با انجمن‌های علمی- پژوهشی و مردمی
• همکاری با انجمن‌های علمی مرتبط با گروه‌های پژوهشی مانند انجمن علمی مدیریت و کنترل مناطق بیابانی یا انجمن علمی مرتع و آبخیزداری کشور

به منظور کاربردی‌تر کردن هرچه بیشتر فعالیت‌های پژوهشی در جهت رفع نیازهای ملی و سازمان‌های مرتبط، زمینه‌های اصلی فعالیت گروه‌های پژوهشی تابعه پژوهشکده به شرح ذیل خواهد بود که با ایجاد قابلیت‌ها و توسعه فعالیت‌ها می‌تواند گسترش یابد:

زمینه فعالیت:

• پژوهش و بررسی جنبه‌های مختلف مناطق خشک و بیابانی
• پژوهش در زمینه حفاظت از منابع طبیعی
• پژوهش پیرامون وضعیت کمی و کیفی پوشش گیاهی مناطق خشک
• مطالعه و بررسی تغییرات کمی و کیفی منابع آب در مناطق خشک
• تبادل دانش درسطح ملی و بین‌المللی با سازمان‌های مرتبط در جهت ارتقا و انتقال تجربیات
• اجرای پروژه‌های تحقیقاتی در زمینه‌های مختلف اکولوژی مناطق بیابانی